Fungsi Bahagian Kesihatan Veterinar secara khususnya adalah seperti berikut:

• Merancang dan melaksanakan program pengawalan, pencegahan, dan pembasmian penyakit haiwan dan zoonotik.
• Mengawalselia pemindahan dan perdagangan ternakan supaya mematuhi peraturan kuarantin dan import/eksport.